卵巢癌是一種預(yù)后極差的婦科惡性腫瘤，5年生存率低于50%。盡管免疫治療在多種癌癥中取得成功，但在卵巢癌中的效果有限。既往研究發(fā)現(xiàn)，卵巢癌組織中CD3+和CD8+ T細(xì)胞的浸潤與預(yù)后相關(guān)，但具體抗原尚不明確。近期研究顯示，HLA I類分子可呈遞非編碼區(qū)域產(chǎn)生的隱秘肽，這些肽段可能成為潛在的腫瘤特異性抗原。本研究旨在探索這些隱秘肽段的免疫原性及其在卵巢癌中的作用。   ? 發(fā)表時間：2025年3月13日 ? 期刊：《Science Advances》 ? 發(fā)表團(tuán)隊(duì)：梅奧診所等團(tuán)隊(duì) ? 文章標(biāo)題：Immunogenic cryptic peptides dominate the antigenic landscape of ovarian cancer ? 核心內(nèi)容：研究通過免疫肽組學(xué)和RNA測序，從5例卵巢癌患者的腫瘤樣本中鑒定出311個隱秘肽段，其中70%能夠激活自體CD8+ T細(xì)胞，表現(xiàn)出顯著的免疫原性。研究還發(fā)現(xiàn)，這些肽段在其他癌癥類型中也有一定的共享性，表明它們可能是一個豐富的免疫治療靶點(diǎn)來源。這些發(fā)現(xiàn)為開發(fā)針對卵巢癌的個性化免疫療法提供了新的方向。 Part1. 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 研究者從5例晚期卵巢癌患者中收集腫瘤組織、相鄰正常組織和腹水樣本，進(jìn)行RNA測序和免疫肽組檢測。利用免疫肽組學(xué)技術(shù)，富集并鑒定HLA I類分子呈遞的肽段，結(jié)合RNA測序構(gòu)建的個性化蛋白數(shù)據(jù)庫，篩選出非編碼區(qū)域產(chǎn)生的隱秘肽段。通過體外T細(xì)胞刺激實(shí)驗(yàn)，評估這些隱秘肽段的免疫原性，檢測其激活自體CD8+ T細(xì)胞的能力。此外，研究還利用公共數(shù)據(jù)庫分析隱秘肽段在其他腫瘤中的表達(dá)情況，以評估其作為免疫治療靶點(diǎn)的潛力。整個實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)涵蓋了從樣本收集到功能驗(yàn)證的全過程，為發(fā)現(xiàn)新的腫瘤抗原提供了有力支持。 圖1. 文章實(shí)驗(yàn)思路和設(shè)計(jì)   Part2. 研究結(jié)果
一、HLA I免疫肽組學(xué)檢測： 通過免疫肽組學(xué)分析，研究者從5例卵巢癌患者的腫瘤樣本中鑒定了HLA I類分子呈遞的肽段。這些肽段的長度分布符合預(yù)期，且與患者的HLA類型匹配。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，免疫肽組學(xué)分析能夠準(zhǔn)確鑒定與HLA I類分子結(jié)合的肽段，為后續(xù)研究奠定了基礎(chǔ)。 圖2. HLA I型免疫肽的檢測結(jié)果     二、隱秘肽的鑒定 研究者利用RNA測序和質(zhì)譜分析，從5例患者的腫瘤樣本中鑒定出311個隱秘肽段，平均每位患者約60個。這些隱秘肽段主要來源于非編碼區(qū)域，如假基因、長非編碼RNA和反義RNA。盡管這些肽段在總免疫肽組中占比不到1%，但它們是主要的抗原類別。 圖3. 卵巢癌中隱秘肽鑒定     三、非編碼的隱秘肽是卵巢癌主要呈遞的抗原類別 研究發(fā)現(xiàn)，隱秘肽段在卵巢癌中的抗原性顯著高于其他已知的腫瘤特異性和腫瘤相關(guān)抗原。這些隱秘肽段在不同患者之間有一定的共享性，并且在其他癌癥類型中也有發(fā)現(xiàn)。這表明隱秘肽段可能是一個豐富的免疫治療靶點(diǎn)來源。 圖4. 非編碼轉(zhuǎn)錄本中的隱秘抗原是腫瘤抗原的可靠來源     四、候選隱秘肽抗原的篩選 研究者篩選出具有高結(jié)合親和力和腫瘤特異性的隱秘肽段。這些肽段在腫瘤組織中的表達(dá)水平顯著高于正常組織，且在正常組織中很少或不表達(dá)。通過這些篩選步驟，研究者成功鑒定了9到10個具有免疫原性的隱秘肽段，為后續(xù)的功能驗(yàn)證提供了候選靶點(diǎn)。    圖5. 候選抗原肽篩選的流程     五、免疫原性的驗(yàn)證 研究者通過體外T細(xì)胞刺激實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)約70%的隱秘肽段能夠激活自體CD8+ T細(xì)胞，表現(xiàn)為4-1BB和IFN-γ表達(dá)增加。此外，研究還通過肽-MHC四聚體檢測到針對這些隱秘肽段的特異性CD8+ T細(xì)胞克隆。這些結(jié)果表明，隱秘肽段具有顯著的免疫原性，能夠激發(fā)T細(xì)胞反應(yīng)。 圖6. 非編碼隱秘抗原能夠激活患者來源的T細(xì)胞   Part3. 研究小結(jié) 本研究通過免疫肽組學(xué)和RNA測序，從5例卵巢癌患者的腫瘤樣本中鑒定出311個隱秘肽段，其中70%能夠激活自體CD8+ T細(xì)胞，表現(xiàn)出顯著的免疫原性。這些發(fā)現(xiàn)為開發(fā)針對卵巢癌的個性化免疫療法提供了新的方向，尤其是在傳統(tǒng)免疫治療效果不佳的患者中。未來的研究需要進(jìn)一步探索隱秘肽段在其他癌癥類型中的作用，并評估其作為免疫治療靶點(diǎn)的潛力。