豬流行性腹瀉病毒（PEDV） S 蛋白的結構、分子量及蛋白標簽_abio生物試劑品牌網(wǎng)
豬流行性腹瀉病毒（PEDV）的 S 蛋白（SPIke 蛋白，刺突蛋白）是病毒表面的重要糖蛋白，在病毒感染宿主細胞過程中起關鍵作用。以下從毒株類型、蛋白結構、分子量及蛋白標簽等方面進行詳細說明：
一、PEDV-S 蛋白的毒株類型及變異PEDV 屬于冠狀病毒科，根據(jù)基因序列差異，主要分為GⅠ 型和GⅡ 型，其中 GⅡ 型又包含多個亞型（如 GⅡa、GⅡb、GⅡd 等）。不同毒株的 S 蛋白序列存在一定變異，尤其是高變區(qū)（如 S1 亞基的 N 端結構域），這是導致病毒抗原性差異和宿主嗜性改變的重要原因。
- 經(jīng)典毒株：如 CV777（GⅠ 型）、DR13（GⅡa 型），S 蛋白序列相對保守，是早期疫苗研發(fā)的主要毒株。
- 變異毒株：如中國近年來流行的 AJ1102（GⅡd 型）、韓國的 SM98 等，S 蛋白的氨基酸突變（尤其是 S1 亞基）更為顯著，可能導致傳統(tǒng)疫苗保護效率下降。
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蛋白結構
- PEDV-S 蛋白是由病毒基因組 ORF1a 和 ORF1b 下游的 S 基因編碼的 Ⅰ 型跨膜糖蛋白，由約 1383-1442 個氨基酸組成，分為S1 亞基和S2 亞基：
- S1 亞基（N 端）：約氨基酸殘基 1-789，負責識別和結合宿主細胞表面受體（如氨肽酶 N，APN），包含多個抗原表位和高變區(qū)，是中和抗體的主要靶點。
- S2 亞基（C 端）：約氨基酸殘基 790-1442，包含跨膜結構域和胞內(nèi)結構域，參與病毒與宿主細胞膜的融合過程，結構相對保守。
- S 蛋白在病毒表面以三聚體形式存在，形成棒狀刺突結構，其空間構象對病毒感染性至關重要。
- PEDV-S 蛋白是由病毒基因組 ORF1a 和 ORF1b 下游的 S 基因編碼的 Ⅰ 型跨膜糖蛋白，由約 1383-1442 個氨基酸組成，分為S1 亞基和S2 亞基：
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分子量
- 未經(jīng)糖基化的 S 蛋白前體分子量約為 150-160 kDa，經(jīng)宿主細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體糖基化修飾后，成熟 S 蛋白的分子量可增加至180-220 kDa（糖基化程度因毒株和宿主細胞而異）。
此處的 “蛋白標簽” 可從功能結構域、抗原表位及研究中常用的標簽蛋白兩方面理解：
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功能結構域標簽（天然結構特征）
- 受體結合域（RBD，Receptor-Binding DomAIn）：位于 S1 亞基，是識別宿主細胞 APN 受體的關鍵區(qū)域，不同毒株的 RBD 序列差異可影響病毒的宿主范圍和感染效率（如變異株可能通過 RBD 突變增強對豬腸上皮細胞的親和力）。
- 融合肽（Fusion Peptide）：位于 S2 亞基 N 端，在病毒與宿主細胞膜融合時插入細胞膜，促進膜融合過程。
- 七肽重復序列（HR1 和 HR2）：位于 S2 亞基，形成螺旋結構，通過構象變化介導膜融合。
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抗原表位標簽（免疫識別位點）
- S 蛋白包含多個線性表位和構象表位，其中構象表位依賴于 S 蛋白的三維結構，是中和抗體的主要作用位點。例如：
- GⅠ 型毒株（如 CV777）的 S1 亞基中，氨基酸殘基 499-513、530-560 等區(qū)域構成主要中和表位；
- GⅡ 型變異株的 S1 亞基高變區(qū)（如氨基酸殘基 300-400、500-600）突變可導致抗原性改變，使傳統(tǒng)疫苗誘導的抗體中和效率降低。
- S 蛋白包含多個線性表位和構象表位，其中構象表位依賴于 S 蛋白的三維結構，是中和抗體的主要作用位點。例如：
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研究中使用的標簽蛋白（人工添加標簽）
- 在基因工程表達和研究中，為便于 S 蛋白的純化、檢測或定位，常人工添加以下標簽：
- His 標簽（組氨酸標簽）：如 6×His 標簽，通過鎳柱親和層析純化重組 S 蛋白，是實驗室常用方法。
- Flag 標簽（DYKDDDDK）：用于 Western blot、免疫共沉淀等檢測，識別抗體商業(yè)化程度高。
- GFP（綠色熒光蛋白）/mCherry 標簽：與 S 蛋白融合表達，用于細胞內(nèi)定位或病毒感染過程的可視化研究。
- 在基因工程表達和研究中，為便于 S 蛋白的純化、檢測或定位，常人工添加以下標簽：
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病毒感染機制
S 蛋白是 PEDV 感染宿主的 “鑰匙”，其 RBD 與 APN 受體的結合是病毒入侵的第一步，而 S2 亞基的膜融合功能則決定了病毒基因組進入宿主細胞的效率。 -
疫苗研發(fā)核心靶點
- 由于 S 蛋白是主要的中和抗原，疫苗研發(fā)（如滅活疫苗、亞單位疫苗、活載體疫苗等）多以 S 蛋白為核心抗原，尤其是 S1 亞基的 RBD 和中和表位區(qū)域。
- 針對變異毒株的 S 蛋白序列優(yōu)化（如嵌合 S 蛋白疫苗）是當前研究熱點，以提高疫苗對流行毒株的交叉保護力。
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診斷與抗體檢測
- 利用重組 S 蛋白（如 S1 亞基）作為包被抗原，可建立 ELISA 等方法檢測血清中的中和抗體，評估豬群免疫狀態(tài)或感染情況。
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