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ComplexHeatmap包繪制密度熱圖的參數調整和添加注釋方法_abio生物試劑品牌網

abiopp6個月前 (06-12)技術53
在展示多樣本數據分布時,除了箱型圖和小提琴圖,密度熱圖也是一個不錯的選擇。下面我們就來了解一下ComplexHeatmap包繪制出的密度熱圖。
 

 
01 密度熱圖介紹 

密度熱圖中每列為一個樣本,顏色體現密度,越接近深紅色密度越高,深藍色為密度低。五條黑色虛線分別對應了五個分位,紅色虛線為均值。

02 參數調整 

修改y軸范圍 

 
修改色階 

 
樣本聚類 


 

添加列注釋 

下圖在上方添加了顏色條,用于區分樣本分組,下方添加了散點圖注釋。


03 添加為熱圖列注釋 

密度熱圖不僅可以添加列注釋,也可以作為列注釋添加在常規熱圖的上方或下方。下圖添加了兩個列注釋,第一個是密度熱圖,用于展示樣本表達值的分布情況;第二個是柱狀圖,用于展示每個樣本中某指標的高低。

 

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