芯空一號(hào)實(shí)現(xiàn)的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)數(shù)據(jù)_abio生物試劑品牌網(wǎng)
Visium空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，作為第一個(gè)商業(yè)化的空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)平臺(tái)，這些年來極大地促進(jìn)了空間組學(xué)的發(fā)展，也助力了很多高影響因子研究成果的發(fā)表。然而，第一代產(chǎn)品55μm尺度，OCT冷凍樣本的實(shí)驗(yàn)方案，還是影響了大量臨床石蠟樣本的檢測(cè)；第二代CytAssist平臺(tái)的升級(jí)，不光實(shí)現(xiàn)了對(duì)石蠟組織樣本的拓展，也解決了樣本用普通玻璃片貼片再進(jìn)行運(yùn)送的問題；第三代Visium HD產(chǎn)品的升級(jí)，再次突破了檢測(cè)分辨率的局限，直接從55μm提高了到2μm分辨率。雖然從分辨率上來說，2μm的大小遠(yuǎn)小于單個(gè)細(xì)胞的直徑，但是從分析角度來說，由于沒有更多的方法協(xié)助，還是做不到單個(gè)細(xì)胞的分辨率。如果有人跟你說，HD就是單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)，放心，他絕對(duì)在忽悠人。
然而，要想實(shí)現(xiàn)HD數(shù)據(jù)單細(xì)胞空間分辨率的夢(mèng)想還是要有的，這會(huì)兒還真能實(shí)現(xiàn)了。利用上機(jī)樣本的HE染色圖片，結(jié)合數(shù)據(jù)2μm尺度的分辨率，我們用新的算法軟件，實(shí)現(xiàn)了對(duì)HD數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞分割的想法。終于，在這個(gè)動(dòng)蕩混亂的時(shí)代，我們還是在艱苦奮斗中有了一點(diǎn)小的突破。終于，在AI智能時(shí)代來臨之際，全轉(zhuǎn)錄組單細(xì)胞分辨率的Visium空間產(chǎn)品問世了。
讓我們一起來看一下HD數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)：
分析一
圖A，HE染色形態(tài)圖；圖B，算法識(shí)別到的細(xì)胞形態(tài)圖；圖C，圖A中紅框區(qū)域識(shí)別到的分割局部圖
分析二
圖A，細(xì)胞分群全局圖；圖B，局部區(qū)域不同Cluster分布；圖C，細(xì)胞注釋全局圖；圖D，局部區(qū)域各細(xì)胞類型分布
分析三
圖A，腸上皮細(xì)胞Enterocyte marker Apoa1的表達(dá)分布總圖；圖B，Apoa1的表達(dá)分布局部圖；圖C，對(duì)應(yīng)圖B區(qū)域的細(xì)胞注釋圖
尖端生命科學(xué)與生物醫(yī)藥創(chuàng)新技術(shù)服務(wù)中心（CITC）-SBC服務(wù)平臺(tái)部深耕組學(xué)研究20年，無論是芯片還是測(cè)序，單細(xì)胞亦或是空間組學(xué)，經(jīng)驗(yàn)豐富的我們與“芯空一號(hào)”，讓您的生命科學(xué)研究更上一層樓。歡迎各位老師前來咨詢！
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