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合成生物學(xué)底盤(pán)細(xì)胞之畢赤酵母常用表達(dá)載體及基因改造技術(shù)_abio生物試劑品牌網(wǎng)

abiopp8個(gè)月前 (04-28)技術(shù)58

酵母表達(dá)系統(tǒng)真核表達(dá)系統(tǒng)中應(yīng)用最廣泛的之一,其中巴斯德畢赤酵母(Komagataella phaffii,又名PIchia pastoris作為甲基營(yíng)養(yǎng)型酵母的代表,近年來(lái)發(fā)展迅速,應(yīng)用廣泛。

畢赤酵母:基因表達(dá)的新紀(jì)元
畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)誕生于上世紀(jì)80 年代初期,它融合了原核表達(dá)系統(tǒng)與真核表達(dá)系統(tǒng)的諸多優(yōu)點(diǎn),迅速在眾多表達(dá)系統(tǒng)中脫穎而出。與原核表達(dá)系統(tǒng)相比,它不僅保留了操作簡(jiǎn)易、易于培養(yǎng)、生長(zhǎng)速度快、表達(dá)量高、成本低特性,還具備原核生物所欠缺的對(duì)外源蛋白的翻譯后修飾能力,如糖基化、蛋白磷酸化等,使表達(dá)的重組蛋白更接近天然產(chǎn)物。同時(shí),它又克服了釀酒酵母分泌效率差、表達(dá)菌株不穩(wěn)定、表達(dá)質(zhì)粒易丟失等缺陷,成為外源蛋白表達(dá)的理想選擇。

畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)的主要優(yōu)勢(shì)
1. 高效AOX1啟動(dòng)子:目前最強(qiáng)、調(diào)控機(jī)制最嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膯?dòng)子之一,便于調(diào)控外源基因的表達(dá)。
2. 蛋白加工修飾功能:可對(duì)表達(dá)的外源蛋白進(jìn)行糖基化、磷酸化、脂類(lèi)酰化等翻譯后修飾,使重組蛋白與天然產(chǎn)物更相似。
3. 低成本與高效生長(zhǎng):菌株生長(zhǎng)迅速,培養(yǎng)基成本低廉,培養(yǎng)條件簡(jiǎn)單。
4. 高表達(dá)量:外源蛋白表達(dá)量高,支持胞內(nèi)和分泌表達(dá)。
5. 基因穩(wěn)定整合:外源基因能在基因組的特定位點(diǎn)以單拷貝或多拷貝形式穩(wěn)定整合,可穩(wěn)定遺傳50代以上。
6. 高密度發(fā)酵:耐受高密度發(fā)酵,便于工業(yè)化生產(chǎn)。

 
P. pastoris生產(chǎn)重組蛋白的流程

畢赤酵母菌株多樣性
當(dāng)前所采用的巴斯德畢赤酵母菌株都源自原始的Y-11430菌,常用的有GS115、KM71、X33和SMD1168等。蛋白胞內(nèi)表達(dá)優(yōu)先選MutS表型,分泌表達(dá)Mut + 和MutS均可;多數(shù)菌株如SMD1168、GS115、KM-71是組氨酸脫氫酶缺陷型,可用不含組氨酸培養(yǎng)基篩選重組子,且SMD1168為蛋白酶缺陷型,適合表達(dá)不穩(wěn)定蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)復(fù)合物以避免內(nèi)源性蛋白酶降解。但SMD1168菌株生長(zhǎng)緩慢,導(dǎo)致蛋白質(zhì)產(chǎn)量低。

畢赤酵母常用表達(dá)載體
畢赤酵母表達(dá)載體分為分泌型和非分泌型兩大類(lèi),分別適用于不同類(lèi)型的蛋白質(zhì)生產(chǎn)需求,其中分泌型載體利用釀酒酵母的分泌信號(hào)序列,有效引導(dǎo)外源蛋白的分泌,提高了蛋白的產(chǎn)量和純度。因此,深入了解和優(yōu)化畢赤酵母表達(dá)載體,對(duì)于提升蛋白生產(chǎn)效率和質(zhì)量至關(guān)重要,也是當(dāng)前生物技術(shù)和基因工程研究中的熱點(diǎn)之一。

常見(jiàn)的用于生產(chǎn)分泌蛋白的畢赤酵母表達(dá)載體【1】

常見(jiàn)的用于生產(chǎn)胞內(nèi)蛋白的畢赤酵母表達(dá)載體【1】

畢赤酵母基因改造技術(shù)
1. 基于線(xiàn)性化質(zhì)粒載體的同源重組
同源重組技術(shù)是一種利用生物體自身修復(fù)機(jī)制的基因工程技術(shù)。在畢赤酵母中,通過(guò)將線(xiàn)性化的質(zhì)粒載體引入,可以高效地將外源基因整合到宿主基因組的特定位點(diǎn)。這一過(guò)程依賴(lài)于同源臂序列,這些序列與目標(biāo)基因組區(qū)域具有高度相似性,從而促進(jìn)了質(zhì)粒載體與宿主DNA之間的重組。這種方法的優(yōu)勢(shì)在于其操作簡(jiǎn)便、整合效率高,可以實(shí)現(xiàn)外源基因的多拷貝插入,這對(duì)于提高基因表達(dá)水平和蛋白質(zhì)產(chǎn)量至關(guān)重要。在工業(yè)生產(chǎn)中,這種技術(shù)常被用于優(yōu)化基因表達(dá),以滿(mǎn)足生物制藥和工業(yè)酶生產(chǎn)的需求。此外,同源重組技術(shù)還可以用于基因功能研究、疾病模型構(gòu)建以及生物技術(shù)產(chǎn)品的開(kāi)發(fā)。

2. 基于CRISPR/Cas9的基因編輯
CRISPR/Cas9系統(tǒng)是一種革命性的基因編輯技術(shù),它通過(guò)利用指導(dǎo)RNA(gRNA)引導(dǎo)核酸酶Cas9精確切割目標(biāo)DNA序列。這種特異性的切割觸發(fā)了細(xì)胞內(nèi)的修復(fù)機(jī)制,包括非同源末端連接(NHEJ)和同源定向修復(fù)(HDR),從而實(shí)現(xiàn)基因的敲除、插入或替換。CRISPR/Cas9技術(shù)以其高效性和精準(zhǔn)性在基因組編輯領(lǐng)域占據(jù)重要地位,特別適用于復(fù)雜代謝途徑的優(yōu)化和多基因編輯。在畢赤酵母中,CRISPR/Cas9技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于基因功能研究、菌株改良以及生產(chǎn)性能的提升。例如,通過(guò)敲除或替換特定基因,可以增強(qiáng)宿主菌的蛋白質(zhì)表達(dá)能力或改變其代謝特性,以適應(yīng)特定的工業(yè)生產(chǎn)需求。

3. 基于CRISPR/Cas12的基因編輯
CRISPR/Cas12系統(tǒng),也稱(chēng)為Cpf1,是CRISPR家族中的另一種基因編輯工具。Cas12蛋白具有廣泛的靶向能力和單鏈DNA切割特性,使其在基因組編輯中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。與Cas9相比,Cas12對(duì)靶位點(diǎn)的PAM(原始間隔短回文重復(fù)序列)依賴(lài)性更寬松,這為基因編輯提供了更大的靈活性。CRISPR/Cas12系統(tǒng)在表觀遺傳調(diào)控和新型生物技術(shù)的開(kāi)發(fā)中展現(xiàn)出巨大潛力,例如,它可以用于研究基因沉默、激活以及DNA甲基化等表觀遺傳修飾。此外,Cas12的單鏈切割特性使其在開(kāi)發(fā)新型核酸檢測(cè)技術(shù)、基因治療策略以及合成生物學(xué)應(yīng)用中具有獨(dú)特的應(yīng)用前景。在畢赤酵母中,CRISPR/Cas12技術(shù)的應(yīng)用還相對(duì)較新,但已有研究表明,它在基因組編輯和基因功能研究中具有巨大的潛力。

畢赤酵母創(chuàng)新突破
經(jīng)過(guò)幾十年的廣泛應(yīng)用,畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)已成功表達(dá)了數(shù)以千計(jì)的異源蛋白,其中大部分為醫(yī)藥制品。美國(guó)FDA 對(duì)該系統(tǒng)的認(rèn)可,如 Cephelon 制劑的獲批,充分證明了其安全性和有效性。在我國(guó),雖然目前上市的基因工程藥物大多源于大腸桿菌原核表達(dá)系統(tǒng),但畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)憑借其國(guó)際上的廣泛認(rèn)可,必將在未來(lái)的醫(yī)藥市場(chǎng)中占據(jù)重要地位。

未來(lái)展望
畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)以其高表達(dá)、高密度、多樣化翻譯后修飾以及無(wú)內(nèi)毒素和病毒的安全性等優(yōu)勢(shì),成為重組蛋白表達(dá)的優(yōu)選平臺(tái)。CRISPR/Cas9等基因組編輯技術(shù)的應(yīng)用將進(jìn)一步推動(dòng)該系統(tǒng)的發(fā)展,助力重組人源蛋白在生物醫(yī)藥、美容護(hù)膚等領(lǐng)域的研究和應(yīng)用。

參考文獻(xiàn)
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